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氣相色譜分析中，一般對于樣品瓶的要求是體積準確、能承受一定的壓力、密封性能良好、對樣品無吸附作用。雖然過去人們也曾用過普通玻璃瓶，但現在大都用硼硅玻璃制成的樣品瓶，其惰性能滿足絕大部分樣品的分析需求。

在定量分析時，要求我們知道樣品瓶的準確體積，而不應簡單的采用生產廠家的標稱體積。一個簡單的方法是先用天平稱量空瓶質量，然后充滿水再稱重。根據水再稱量溫度下的密度即可計算出樣品瓶的準確體積。

市售樣品瓶的體積有5~22ml多種，具體選用哪種，第一要根據儀器要求而定，第二要看樣品情況而定，第三要考慮色譜柱。液體樣品采用10ml左右的瓶子多數就能滿足要求，因為分析靈敏度是取決于待測組分在氣體中的濃度，而不是樣品量。

樣品瓶最好只用一次，若要反復使用，就一定要保證清潔干凈。建議的清洗方法是：先用洗滌劑清洗，然后用蒸餾水洗，再用色譜純乙醇清洗，最后置于烘箱中烘干。也可以用甲醇，更容易揮發干凈，但毒性較大。